Такая ситуация - письма в Inbox'е не отображаются в MailTicker'е плюс к этому Мышь не показывает, что в Inbox есть новые письма, пока не перейдешь туда. Отображение MailTicker'а - Automaticaly, галка "Show unread messages" в свойствах Inbox установлена.
Нэхорошо…
The Bat! 2.0, хотя с этой же проблемой сталкивался в одной из 1.63 beta (6 или 7, не помню точно; в beta 11 этого точно не было).