mvi, а что за версию вы используете? Я бы рекомендовал попробовать последний 3.63.05
P.S. по поводу "Автофильтрация" - эта галка работает совместно с "в он-лайне обновлять каждые…". Если после такого обновления обнаружены новые письма, то запускаются фильтры. Когда галка выключена фильтры работают только после наступания на папку.